Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp8b3Q6UQ17 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms