Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8B1Q6J4K2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8B1Q6J4K2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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