Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RPE65Q16518 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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