Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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