Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNG1Q06432 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms