Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms