Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms