Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms