Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NELFEP18615 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NELFEP18615 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NELFEP18615 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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