Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB3O43889 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB3O43889 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CREB3O43889 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 588.4 ms