Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms