Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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