Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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