Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms