Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms