Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PKDCCQ504Y2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms