Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA1P17302 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms