Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms