Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms