Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim54Q9ERP3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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