Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3AQ96ST3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms