Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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