Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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ATP1A4Q13733 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ATP1A4Q13733 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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