Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LDB2O43679 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDB2O43679 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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