Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PRAMEF25A6NGN4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PRAMEF25A6NGN4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PRAMEF25A6NGN4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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