Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF22A3QJZ6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms