Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP20Q9Y2K6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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