Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DDIT4Q9NX09 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDIT4Q9NX09 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms