Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MMP26Q9NRE1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms