Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms