Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms