Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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