Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF8Q3BBV2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF8Q3BBV2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms