Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB3GAP1Q15042 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms