Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms