Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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