Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPB42P16452 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPB42P16452 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPB42P16452 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPB42P16452 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms