Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCAO15360 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms