Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms