Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCTN4Q9UJW0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCTN4Q9UJW0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCTN4Q9UJW0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCTN4Q9UJW0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms