Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms