Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHH5

Agap3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agap3Q8VHH5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agap3Q8VHH5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap3Q8VHH5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap3Q8VHH5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms