Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx8Q8CFD4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx8Q8CFD4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx8Q8CFD4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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