Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm9955Q8CEJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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