Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sys1Q78S06 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sys1Q78S06 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms