Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Efr3bQ6ZQ18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efr3bQ6ZQ18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms