Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cep78Q6IRU7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cep78Q6IRU7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep78Q6IRU7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms