Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl13bQ640N2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl13bQ640N2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl13bQ640N2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl13bQ640N2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl13bQ640N2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl13bQ640N2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl13bQ640N2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl13bQ640N2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl13bQ640N2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms