Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolaQ61183 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PapolaQ61183 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolaQ61183 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolaQ61183 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolaQ61183 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolaQ61183 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolaQ61183 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolaQ61183 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolaQ61183 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms