Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trdv2-2Q5R1A4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms